Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Afg3l2Q8JZQ2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms