Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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Znf628Q8CJ78 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Znf628Q8CJ78 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Znf628Q8CJ78 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Znf628Q8CJ78 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Znf628Q8CJ78 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Znf628Q8CJ78 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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