Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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