Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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