Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ercc8Q8CFD5 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ercc8Q8CFD5 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ercc8Q8CFD5 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ercc8Q8CFD5 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ercc8Q8CFD5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ercc8Q8CFD5 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ercc8Q8CFD5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ercc8Q8CFD5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ercc8Q8CFD5 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ercc8Q8CFD5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ercc8Q8CFD5 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ercc8Q8CFD5 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ercc8Q8CFD5 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ercc8Q8CFD5 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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