Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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