Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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