Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms