Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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Atg16l1Q8C0J2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Atg16l1Q8C0J2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Atg16l1Q8C0J2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Atg16l1Q8C0J2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Atg16l1Q8C0J2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Atg16l1Q8C0J2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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