Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ctdsp2Q8BX07 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ctdsp2Q8BX07 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ctdsp2Q8BX07 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ctdsp2Q8BX07 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ctdsp2Q8BX07 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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