Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pdcl3Q8BVF2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pdcl3Q8BVF2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pdcl3Q8BVF2 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pdcl3Q8BVF2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pdcl3Q8BVF2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Pdcl3Q8BVF2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Pdcl3Q8BVF2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdcl3Q8BVF2 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdcl3Q8BVF2 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdcl3Q8BVF2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdcl3Q8BVF2 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdcl3Q8BVF2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdcl3Q8BVF2 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdcl3Q8BVF2 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdcl3Q8BVF2 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdcl3Q8BVF2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdcl3Q8BVF2 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdcl3Q8BVF2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdcl3Q8BVF2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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