Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms