Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdca8Q8BHX3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms