Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW7

Lpp, Lipoma-preferred partner homolog, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LppQ8BFW7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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LppQ8BFW7 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LppQ8BFW7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms