Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.6Q85ZW5 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
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