Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms