Protein–RNA interactions for Protein: Q80W14

Prpf40b, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf40bQ80W14 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Prpf40bQ80W14 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Prpf40bQ80W14 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Prpf40bQ80W14 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Prpf40bQ80W14 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Prpf40bQ80W14 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Prpf40bQ80W14 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Prpf40bQ80W14 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Prpf40bQ80W14 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Prpf40bQ80W14 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Prpf40bQ80W14 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Prpf40bQ80W14 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Prpf40bQ80W14 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Prpf40bQ80W14 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf40bQ80W14 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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