Protein–RNA interactions for Protein: Q80TR4

Slit1, Slit homolog 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit1Q80TR4 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slit1Q80TR4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slit1Q80TR4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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