Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Clec18aQ7TSQ1 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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