Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Dsg1bQ7TSF1 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Dsg1bQ7TSF1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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