Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms