Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms