Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.9 ms