Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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