Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms