Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Krt40Q6IFX3 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Krt40Q6IFX3 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Krt40Q6IFX3 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Krt40Q6IFX3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Krt40Q6IFX3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Krt40Q6IFX3 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Krt40Q6IFX3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Krt40Q6IFX3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Krt40Q6IFX3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Krt40Q6IFX3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Krt40Q6IFX3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Krt40Q6IFX3 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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