Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Atg9bQ6EBV9 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Atg9bQ6EBV9 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Atg9bQ6EBV9 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Atg9bQ6EBV9 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Atg9bQ6EBV9 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Atg9bQ6EBV9 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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