Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6DFW0 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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