Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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