Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms