Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Col4a5Q63ZW6 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Col4a5Q63ZW6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Col4a5Q63ZW6 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Col4a5Q63ZW6 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Col4a5Q63ZW6 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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