Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms