Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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