Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc5a6Q5U4D8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms