Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms