Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 C030010L15Rik-201ENSMUST00000181465 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Lrrc43Q3V0L5 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Lrrc43Q3V0L5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Lrrc43Q3V0L5 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Lrrc43Q3V0L5 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms