Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ttc9Q3V038 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ttc9Q3V038 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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