Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Rnf165-201ENSMUST00000026494 7300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms