Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms