Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms