Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms