Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms