Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rnf224Q3UIW8 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rnf224Q3UIW8 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rnf224Q3UIW8 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rnf224Q3UIW8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rnf224Q3UIW8 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rnf224Q3UIW8 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rnf224Q3UIW8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rnf224Q3UIW8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rnf224Q3UIW8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rnf224Q3UIW8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rnf224Q3UIW8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rnf224Q3UIW8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rnf224Q3UIW8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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