Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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