Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc177Q3UHB8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms