Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms