Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U595 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U595 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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