Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms