Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gse1Q3U3C9 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gse1Q3U3C9 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gse1Q3U3C9 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gse1Q3U3C9 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gse1Q3U3C9 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gse1Q3U3C9 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gse1Q3U3C9 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gse1Q3U3C9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gse1Q3U3C9 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gse1Q3U3C9 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gse1Q3U3C9 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gse1Q3U3C9 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gse1Q3U3C9 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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