Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms